- Административная комиссия
- Департамент внешних связей и реализации инвестиционных проектов
- Департамент градостроительства
- Департамент жилищно-коммунального хозяйства и энергетики
- Департамент имущественных и земельных отношений
- Департамент по связям с общественностью и взаимодействию со СМИ
- Департамент предпринимательства, потребительского рынка и развития туризма
- Департамент финансов
- Департамент экономики
- Комиссия по делам несовершеннолетних
- Контрольно-ревизионное управление
- Отдел опеки и попечительства
- Отдел охраны труда
- Правовой департамент
- Управление архитектуры и градостроительной политики
- Управление внедрения информационных технологий и муниципальных услуг
- Управление кадров
- Управление культуры и духовного развития
- Управление молодежи и семейной политики
- Управление муниципального контроля
- Управление муниципальных закупок
- Управление образования
- Управление по взаимодействию с правоохранительными органами и противодействию коррупции
- Управление сельского хозяйства
- Управление транспорта и дорожной инфраструктуры
- Управление физической культуры и спорта
- МКК Фонд развития города Якутска
